北京中科白瘕风刘云涛 http://disease.39.net/bjzkbdfyy/171028/5798904.html

世界脑炎日（WorldEncephalitisDay）于年由脑炎协会（theEncephalitisSociety）发起创立，定于每年2月22日举行。今年脑炎日的主题为：Lights,Camera,Action！即号召人们用红色点亮当地地标，穿着红色T恤并拍照，用行动提高脑炎意识。

医院

关鸿志教授团队的“浪漫”仪式

为此，微远基因特别推出系列活动——IDseqTM+AIdet（自身免疫性脑炎抗体检测AutoImmuneencephalitisdetection）检测组合，让脑炎病因“显而易见”。

脑炎是一种由感染或自身免疫原因所致的中枢神经系统炎症性疾病，发病率和死亡率在所有神经系统疾病中较高1。导致感染性脑炎的病原微生物复杂多样，使得中枢神经系统感染近50%病因不明2-3。自身免疫性脑炎占病因未明患者的10%-20%，确诊需要审慎“合理的排除其它病因”。随着病原宏基因组学（mNGS）和自身免疫脑炎抗体的研究与应用，我们对脑炎的病因、病理机制等都有了更完善的认识4。

1

“改变世界”的第一例

年，加利福尼亚大学旧金山分校的MichaelWilson教授在《新英格兰医学杂志》发表一篇案例，在患儿脑脊液中，临床借助mNGS技术48小时内检出一种罕见的病原体——圣地罗西钩端螺旋体。该病例报告是mNGS临床检测的首次成功运用，开启了mNGS迅速临床转化的大门，在其后的4年中被引用余次5。

2

mNGS可识别常规检测中遗漏的病原体

近年来，mNGS技术凭借无偏好性，可一次性检出DNA和RNA病毒、细菌、真菌和寄生虫等多种病原体的技术优势，让引起脑炎的疑难罕见病原体得以检出（如猫立克次体6、詹姆斯敦峡谷病毒7等）。年，MichaelWilson教授团队通过与传统方法学如培养、PCR和血清学检测等对比，评估了mNGS在原发性脑炎、脑膜炎和脊髓炎患者的临床应用效能，结果显示mNGS检出22%临床其他检测方法结果阴性的病例8，可为临床诊断提供有力的病原学依据。

图1患者诊断及mNGS与传统方法结果的比较

我国已有数十篇报道，涉及布鲁氏菌、单核增生李斯特菌、脑囊虫、人类疱疹病毒、恙虫病、阿米巴原虫、曼氏裂头蚴等诸多罕见重要病原体引起的重症中枢神经系统感染9。医院关鸿志教授等曾指出：在中国，脑脊液mNGS的应用有助于感染性脑炎诊断水平的均质化——即使面对疑难、罕见、新发脑炎病例和各地水平不等的实验诊断条件，如果“全病原体”检测方法的渠道实现充分的可及性，对病原体的诊断水平就有希望趋于同一。

3

mNGS显著提高病原体检测阳性率

年，美国加州大学CharlesChiu教授团队与医院神经科关鸿志教授牵头的脑炎协作组先后在《新英格兰医学杂志》和《BioRxiv》发表两篇mNGS脑炎/脑膜炎多中心研究，指出mNGS可以显著提高病原体的阳性率，可达36.6%（图2）10。

图2两个团队mNGS检测阳性率

医院张文宏教授团队研究显示，将mNGS与常规方法（包括培养，涂片等）进行比较，mNGS的阳性率显著提高（使用抗生素：34.4%vs7.6%，未使用抗生素：50%vs25%），且mNGS受抗生素使用的影响较小。

图3有效治疗时间对中枢神经系统感染不同方法学阳性率的影响

但对有效抗菌治疗时间长度的分析显示，如果患者在脑脊液采样之前接受有效的抗菌治疗超过4天，则mNGS的检出率将显著下降（44.79％至22.68％，54.35％至28.95％），结果如图3所示11。

4

IDseq?+AIdet，让脑炎病因“显而易见”

年，微远基因通过高效破壁技术联合优化去宿主技术，升级病原宏基因组学检测产品IDseq?，实现了致病微生物特别是病毒、真菌和胞内菌的高敏检测；引入中国流行病原谱与基因组数据，让重要近缘病原体与病毒分型鉴定准确度显著提供。截至年11月，微远基因在全国范围内协助临床共确诊近百例肠病毒导致的脑炎,展示了2.0时代宏基因组学联合宏转录组学的丰硕成果。

图4微远基因肠病毒检出情况统计

年，医院与微远基因合作报道了一例广州管圆线虫合并人类疱疹病毒I型（HSV-1）感染的罕见病例，临床改变用药进行针对性治疗，患者顺利康复，经后续随访患者恢复正常，无神经系统后遗症。相应研究报道发表在CMJ杂志上12。

图5医院与微远基因合作

发表在CMJ杂志的文章

IDseq?DNA+RNA双流程检测涵盖不同遗传物质的病原体；结合自身免疫性脑炎抗体检测（AIdet），可以为脑炎诊断提供多重解决方案。今天，微远基因诚邀大家在年世界脑炎日一起，让临床在感染性脑炎与自身免疫性脑炎之间鉴别诊断，让脑炎病因“显而易见”！

微远基因系列活动进行中，敬请期待

IDseq?从海量宏基因组数据中探明感染微生物，实现感染性疾病病原体的快速、准确和全面鉴定，辅助临床感染诊疗，让感染诊断快速精准，为疑难危重感染病患保驾护航。

我们深深明了

每一份珍贵样本的背后

都有一位亟待救治的病患

微远基因

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